Самой знаменитой церковью Оломоуца, конечно, является кафедральный собор Святого Вацлава. В конце 19-го столетия она была восстановлена в неоготическом стиле, но до сих пор в ней сохранились многочисленные части от первой церкви на месте современного собора, которую также много раз перестраивали от романского до готического и барочного стилей. Самый высокий из трех шпилей собора достигает высоты 100 метров.
Церковь Святого Николая в Оломоуце представляет собой церковь в стиле барокко, и является одной из самых известных и популярных церквей города. Современный внешний вид церковь получила в результате реконструкции оригинальной готической церкви. Богатое скульптурное и живописное убранство интерьера церкви демонстрируют величие искусства в стиле Барокко. Фасады церкви украшены скульптурами Святой Девы Марии и Спасителя работы великого Андераса Захнера и относятся к первой половине 18-ого столетия.
Также стоит отметить церковь Святого Мориса, которая представляет собой готическое здание 15-ого столетия. Необарочная часовня Святого Яна Саркандера стоит на месте бывшей городской тюрьмы Оломоуца. Католический священник Ян Саркандер был заключен в тюрьму в Оломоуце в начале Тридцатилетней войны. Его обвиняли в сотрудничестве с врагом, он умер от пыток в местной тюрьме, так и не признав свою вину. Стойка, на которой пытали Яна, и его могильный камень сохранены в часовне. Сам Ян Саркандер был канонизирован во время папства Иоанна Павла Второго во время его посещения Оломоуца в 1995 году.
Другая церковь, которую посетил Папа Римский во время своего визита в Оломоуц – это церковь Девы Марии, которая расположена на Святом Холме. Церковь Девы Марии представляет собой пример чешской барочной архитектуры и возвышается над городом. Также в Оломоуце есть несколько монастырских комплексов, включая знаменитый Монастырь Градиско, Женский монастырь доминиканских сестер в Оломоуце. Ко всему в Оломоуце есть православная церковь, построенная в типичном стиле российской религиозной архитектуры.
